重庆医科大学附属第二医院是集医疗、教学、科研、预防保健为一体的国家三级甲等综合医院。拥有价值4亿元的现代化医疗仪器设备,有44个临床和医技科室。感染病科和神经内科为国家重点学科,心血管内科、呼吸内科、肾内科、感染科、医学影像科为国家临床重点专科,中医康复科为国家中医药管理局“十二五”临床重点专科。临床医学一级学科为省级重点学科,其覆盖的16个二级学科全部是省级重点学科;医学影像学、康复医学与理疗学、内科学(传染病学)、妇产科学为重庆市医学重点学科。有卫生部批准的高强度聚焦超声(HIFU)肿瘤治疗培训基地,是卫生部第一批心律失常介入诊疗(导管消融和植入器械)培训基地、重庆市首批获得血液透析技术资格准入的医院之一