医院承担了全市重大突发公共卫生事件、突发传染病的医疗救治工作，是市中心城区及各县（市）转诊传染病病人的集中收治医院，并负责全市医疗机构的艾滋病、结核病、肝病等法定传染性疾病的培训、会诊、业务指导等工作任务，同时承担了城西片区居民的医疗保健工作和医疗急救工作任务赣州市第五人民医院始建于1955年，前身是赣南行署结核病防治所，现已发展成为一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等公立医院。赣州市第五人民医院于2006年批准成立，2008年11月挂牌运行，同时挂牌赣南医学院附属赣州市第五人民医院、赣州市肝病医院、赣州市肺科医院、赣州市传染病医院，实行五块牌子一套人马，是以肝病、肺病、职业病、传染病治疗为特色的专科型综合医院，是赣南医学院第九临床医学院、赣州市卫生学校教学医院。
